土榨油中可能保留了很多原料中的有益成分（酚类、VE、胡萝卜素等），但同时，因为方法简单，设备简陋，出油环境较差，缺乏严格质量管理，土榨油也有令人担忧的食品安全隐患：
小作坊生产，环境堪忧
小作坊式油厂生产条件简陋，卫生难以保障，生产出来的油品大多数统一装在大油桶里面，主要以散装形式销售。
原料筛选不过关，质量堪忧
因大多数小作坊人力物力资源有限，土榨原料基本没有经过严格的筛选和检测，有的小作坊为了获得更高利润，节约成本，甚至没有考虑过要筛选原料，可能会使用混有霉变的原料榨油。比如，采用含霉变花生的原料得到的土榨花生油，其黄曲霉毒素（目前发现的最强化学致癌物之一，其毒性约是砒霜的68倍）很可能超标。此外，还有杀虫剂、重金属等污染的原料。
工艺粗糙，污染物堪忧
土榨预处理时会涉及高温烘烤过程，其多环芳烃含量很可能超标。